Ⅰ 研究基因互作的常用方法是
質量性狀中存在6種可能的基因互作類型, 即互補,重疊,累加,顯性上位,隱性上位和抑制.在遺傳研
究中, 有時會遇到互作基因定位的問題, 但至今未見有關互作基因定位方法
基因互作
兩對非等位基因共同作用於同一性狀的現象叫做基因互作.如:加拿大大麻哈魚肉色的遺傳就是兩個顯性基因的互作:
紅色肉(RRMM) ×白色肉(rrmm)
F1: 紅色肉(RrMm)
F2: 9紅色肉 : 7白色肉
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基因互作方式之一:互補作用
花鱂的體色遺傳——兩對基因的互補:
淡藍色(BBrr) ×淡白色(bbRR)
F1: 灰色(BbRr)
F2: 9/16B_R_+3/16B_rr+3/16bbR_+1/16bbrr
灰色 淡藍色 淡白色 白色
×
基因互作方式之二:累加作用
虎皮䰾軀幹部條紋遺傳——兩對基因的累加作用
不完全帶aaBB×不完全帶AAbb
F1: 全帶(AaBb)
F2: 9A_B_:6(A_bb+aaB_):1aabb
全帶 不完全帶 半帶
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基因互作方式之三:顯性上位作用
例如:金魚體色的顯性上位遺傳:
淺黑色AABB × 白化aabb
AaBb淺黑
12淺黑A_B_+3A_bb : 3淡色aaB_:1aabb白化
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基因互作方式之四:隱性上位作用
劍尾魚尾鰭的黑色素——隱性上位遺傳:
CCPP黑色彎帶 × ccpp無色
CcPp黑色彎帶
9黑色彎帶C_P_:3C_aa黑斑:4無色cc_ _
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基因互作方式之五:重疊作用
鯉魚體色青灰色與紅色基因的重疊作用——15:1
青灰色元江鯉 BBRR×紅色荷包紅鯉bbrr
青灰色BbRr
15青灰(9B_R_+3B_rr+3bbR_):1紅bbrr
×
只能找到這些了
希望能對你有幫助
Ⅱ 超過4000個基因如何做蛋白質相互作用網路
蛋白質是氨基酸脫水縮合的產物,DNA是氨基+五碳糖+高能磷酸鍵復合結構的聚合
DNA是遺傳物質,蛋白質在生物體中起多種作用
Ⅲ 簡述基因互作的機制
基因互作指不同基因間的相互作用,可以影響性狀的表現。
1.互補效應兩對獨立遺傳基因分別處於純合顯性或雜合顯性狀態時共同決定一種性狀的發育;當只有一對基因是顯性,或兩對基因都是隱性時,則表現為另一種性狀,F2產生9:7的比例。
2.積加效應兩種顯性基因同時存在時產生一種性狀,單獨存在時能分別表示相似的性狀,兩種基因均為隱性時又表現為另一種性狀,F2產生9:6:1的比例。
3.重疊效應 兩對或多對獨立基因對表現型能產生相同的影響,F2產生15:1的比例。重疊作用也稱重復作用,只要有一個顯性重疊基因存在,該性狀就能表現。 重疊基因:表現相同作用的基因。
4.顯性上位作用上位性:兩對獨立遺傳基因共同對一對性狀發生作用,其中一對基因對另一對基因的表現有遮蓋作用; 下位性:與上述情形相反,即後者被前者所遮蓋。 顯性上位:起遮蓋作用的基因是顯性基因,F2的分離比例為12:3:1。
5.隱性上位作用在兩對互作的基因中,其中一對隱性基因對另一對基因起上位性作用,F2的分離比例為9:3:4。 此上位作用與顯性作用不同,上位性作用發生於兩對不同等位基因之間,而顯性作用則發生於同一對等位基因的兩個成員之間。
6.顯性抑製作用: 在兩對獨立基因中,其中一對顯性基因,本身並不控制性狀的表現。但對另一對基因的表現有抑製作用,稱這對基因為顯性抑制基因.F2的分離比例為13:3。
Ⅳ 如何搜索基因之間相互作用
如何搜索基因之間相互作用
自上個世紀90年代中期全基因組測序技術出現後,一種新技術方法也隨著迅猛發展,這種稱為基於約束的通量分析的方法通過一系列針對基於約束的構建和模擬用途而編寫的函數進行模擬運算。
近幾年COBRA已經被用於預測細胞的功能,比如預測不同基質條件下細胞生長的能力,以及基因敲除在全基因組范圍內的影響。不少科學家們希望能了解並應用這種方法,尤其是在代謝工程,抗生素設計和酶研究方面。
全基因組范圍的代謝網路在基因組序列的基礎上,結合基因功能注釋信息,把基因編碼蛋白所催化的生化反應構建為一個代謝網路,反應了基因-蛋白質-生化反應之間的相互作用,從而有效地轉化為數學模型在計算機上進行模擬、分析,並用實驗數據加以驗證,提出假設。
Ⅳ 如何根據差異表達基因建立互作網路圖
基因互作是指非等位基因之間通過相互作用影響同一性狀表現的現象。廣義上,基因互作可分為基因內互作和基因間互作。基因內互作是指等位基因間的顯隱性作用。基因間互作是指不同位點非等位基因之間的相互作用,表現為互補,抑制,上位性等。
基因互作:雞冠的形狀很多,除常見的單冠外,還有胡桃冠、玫瑰冠和豌豆冠等
互補效應:子一代自交,子二代中應該9/16C_P_,3/16C_pp,3/16ccP_,1/16ccpp,由於顯性基因C與顯性基因P間的互補作用,只有9/16 C_P_在表型上是紅花,其餘的7/16都是白
積加作用:是指兩種顯性基因同時存在時產生一種性狀,單獨存在 時,分別表現相似的性狀。
例如,南瓜有不同的果形,圓球形對扁盤形為隱性,長圓形對圓球形為隱性。如果用兩種不同基因型的圓球形品種雜交,F1產生扁盤形, F2出現三種果形:9/16扁盤形,6/16圓球形,1/16長圓形花,在這里C與P是互補基因
重疊作用:是指不同對基因互作時,對表現型產生相同的影響,F2 產生15∶1的比例。這類表現相同作用的基因,稱為重疊基因。
例:將薺菜三角形蒴果與卵圓形蒴果植株雜交,F1全是三角形蒴果。 F2分離為 15/16三角形蒴果∶1/16卵形蒴果
Ⅵ 簡述基因之間相互作用的種類和具體類型
非等位基因相互作用①互補基因。若干非等位基因只有同時存在時才出現某一性狀,其中任何一個發生突變時都會導致同一突變型性狀,這些基因稱為互補基因。
②異位顯性基因。影響同一性狀的兩個非等位基因在一起時,得以表現性狀的基因稱為異位顯性基因或稱上位基因。
③累加基因。對於同一性狀的表型來講,幾個非等位基因中的每一個都只有部分的影響,這樣的幾個基因稱為累加基因或多基因。在累加基因中每一個基因只有較小的一部分表型效應,所以又稱為微效基因。相對於微效基因來講,由單個基因決定某一性狀的基因稱為主效基因。
④修飾基因。本身具有或者沒有任何錶型效應,可是和另一突變基因同時存在便會影響另一基因的表現程度的基因。如果本身具有同一表型效應則和累加基因沒有區別。
⑤抑制基因。一個基因發生突變後使另一突變基因的表型效應消失而恢復野生型表型,稱前一基因為後一基因的抑制基因。如果前一基因本身具有表型效應則抑制基因和異位顯性基因沒有區別。
⑥調節基因。一個基因如果對另一個或幾個基因具有阻遏作用或激活作用則稱該基因為調節基因。調節基因通過對被調節的結構基因轉錄的控制而發揮作用。具有阻遏作用的調節基因不同於抑制基因,因為抑制基因作用於突變基因而且本身就是突變基因,調節基因則作用於野生型基因而且本身也是野生型基因。
⑦微效多基因。影響同一性狀的基因為數較多,以致無法在雜交子代中明顯地區分它們的類型,這些基因統稱為微效多基因或稱多基因。
⑧背景基因型。從理論上看,任何一個基因的作用都要受到同一細胞中其他基因的影響。除了人們正在研究的少數基因以外,其餘的全部基因構成所謂的背景基因型或稱殘余基因型。
編輯本段等位基因的相互作用1932年H.J.馬勒依據突變型基因與野生型等位基因的關系歸納為無效基因、亞效基因、超效基因、新效基因和反效基因。
①無效基因。不能產生野生型表型的、完全失去活性的突變型基因。一般的無效基因卻能通過回復突變而成為野生型基因。
②亞效基因。表型效應在性質上相同於野生型,可是在程度上次於野生型的突變型基因。
③超效基因。表型效應超過野生型等位基因的突變型基因。
④新效基因。產生野生型等位基因所沒有的新性狀的突變型基因。
⑤反效基因。作用和野生型等位基因相對抗的突變型基因。
⑥鑲嵌顯性。對於某一性狀來講,一個等位基因影響身體的一個部分,另一等位基因則影響身體的另一部分,而在雜合體中兩個部分都受到影響的現象稱為鑲嵌顯性。
Ⅶ 蛋白相互作用網路怎麼畫
蛋白質相互作用資料庫見下表所示: 資料庫名 BIND DIP IntAct InterDom MINT STRING HPRD HPID MPPI 蛋白質相互作用的預測方法很非常多,以下作了簡單的介紹 1) 系統發生譜 這個方法基於如下假定:功能相關的(functionally related)基因,在一組。
Ⅷ 簡述基因之間相互作用的種類和具體類型
1.互補效應(complementary effect)
兩對獨立遺傳基因分別處於純合顯性或雜合顯性狀態時共同決定一種性狀的發育;當只有一對基因是顯性,或兩對基因都是隱性時,則表現為另一種性狀,F2產生9:7的比例.
2.積加效應(additive effect)
兩種顯性基因同時存在時產生一種性狀,單獨存在時能分別表示相似的性狀,兩種基因均為隱性時又表現為另一種性狀,F2產生9:6:1的比例.
3.重疊效應(plicate effect)
兩對或多對獨立基因對表現型能產生相同的影響,F2產生15:1的比例.重疊作用也稱重復作用,只要有一個顯性重疊基因存在,該性狀就能表現.
重疊基因:表現相同作用的基因.
4.顯性上位作用(epistatic dominance)
上位性:兩對獨立遺傳基因共同對一對性狀發生作用,其中一對基因對另一對基因的表現有遮蓋作用;
下位性:與上述情形相反,即後者被前者所遮蓋.
顯性上位:起遮蓋作用的基因是顯性基因,F2的分離比例為12:3:1.
5.隱性上位作用(epistatic recessiveness)
在兩對互作的基因中,其中一對隱性基因對另一對基因起上位性作用,F2的分離比例為9:3:4.
此上位作用與顯性作用不同,上位性作用發生於兩對不同等位基因之間,而顯性作用則發生於同一對等位基因的兩個成員之間.
6.抑製作用(inhibiting effect)
顯性抑製作用:
在兩對獨立基因中,其中一對顯性基因,本身並不控制性狀的表現.但對另一對基因的表現有抑製作用,稱這對基因為顯性抑制基因.F2的分離比例為13:3.
Ⅸ 基因互作的介紹
基因互作是指非等位基因之間通過相互作用影響同一性狀表現的現象。廣義上,基因互作可分為基因內互作和基因間互作。基因內互作是指等位基因間的顯隱性作用。基因間互作是指不同位點非等位基因之間的相互作用,表現為互補,抑制,上位性等。
Ⅹ cytoscape繪制某類基因的互作關系,需要什麼輸入文件
就是一個txt文件就可以,一共三列,第一列和第三列是互作的點,第二列是互作的方式,如果只有一種互作方式可以不要第二列,如果想標出不同種類的點再導入點屬性文件,兩列,第一列是點,第二列是點的類別,一般用1,2,3表示,只想畫圖的話不需要插件,如果要做分析可以下相應的插件