网络药理学怎么分析中药信号通路

㈠ 网络药理学如何写论文

网络药理学写论文的材料素材：

1、从要研究的方剂/中药中获得有效成分。

2、根据有效成分预测靶基因。

3、根据表型获得对应的靶基因。

4、有效成分对应的靶基因与表型对应的靶基因取交集。

5、构建中药/方剂有效成分靶基因网络。

写作技巧

基于系统生物学的理论，对生物系统的网络分析，选取特定信号节点(Nodes)进行多靶点药物分子设计的新学科。网络药理学强调对信号通路的多途径调节，提高药物的治疗效果，降低毒副作用，从而提高新药临床试验的成功率，节省药物的研发费用。

其中中药/方剂通过某某基因调节某某通路治疗表型的研究，研究侧重于细节研究，把网络药理学当作筛选靶基因、通路的手段，再用常规的分子生物学、细胞生物学的技术加以验证。如果研究细节到位，可以冲击3-10分作用的SCI期刊。

㈡ 网络药理学的介绍

网络药理学是基于系统生物学的理论，对生物系统的网络分析，选取特定信号节点（Nodes）进行多靶点药物分子设计的新学科。网络药理学强调对信号通路的多途径调节，提高药物的治疗效果，降低毒副作用，从而提高新药临床试验的成功率，节省药物的研发费用。

㈢ 网络药理学画图时怎么一个圈移动

1、找到左上角工具栏里面的虚线方框，点击。
2、待鼠标变成中心是圈的十字架后把想移动的一个圈框起来。
3、把鼠标移动到圆圈中间，按住左键，拖动即可。

㈣ 网络药理学的发展背景

在以前的药物研发模式中，主要遵循“一个药物、一个基因、一种疾病”的模式，这是导致70%的新药在临床试验失败的主要原因。实际上，临床上的多种慢性病如肿瘤、心脑血管疾病、糖尿病等都是多基因、多因素作用的疾病，仅根据单一作用靶点难以达到良好治疗的效果。以肿瘤的发生为例：形成一个立方厘米的实体瘤需要10年的时间，经过6大步骤：克服凋亡、抑制衰老（无限增殖）、分泌自我增殖信号、对生长信号不敏感、血管新生和侵袭，其中有大量的基因和蛋白参与作用。
基于网络药理学形成药物分子设计新模式，是发展创新药物的重要途径。

㈤ 什么是系统药理学

系统药理学（Systems Pharmacology）是一种学科，它是多学科交叉的产物，包括经典药理学、化学生物学、生物化学和结构生物学、基因组学、病理学，医学以及应用数学、计算机技术、生物信息学等。
系统药理学是多学科交叉的产物，包括经典药理学、化学生物学、生物化学和结构生物学、基因组学、病理学，医学以及应用数学、计算机技术、生物信息学和“－omics”方法，同时涵盖了大量实验学科包括从细胞、组织到器官的研究技术。系统药理学被认为是未来转化医学的核心技术。
1.1 ADME/T评价与药代计量学
药物的吸收（absorption）、分布（distribution）、代谢（metabolism）及排泄（excretion）过程的是药物发现进程中的一个重要进程。药物分子进入机体，首先要克服ADME/T屏障，才可能是活性分子。这些分子和机体内的靶标结合进而产生药效，药物将会在网络水平以及器官整体水平上和机体发生相互作用。因此ADME/T 评价、药物计量学、药代计量学分析是药物早起开发和化学分子成药性的关键内容之一。
1.2 系统打靶和通路关联
发现和阐明活性物质、发现靶标是药物发现研究的核心。然而传统的基于还原论的做法是通过分析化学手段获取化学成分，采用分子生物学和生物化学技术开展实验验证，寻找可能的靶点。当前开展网络靶标预测、药物-靶标关联是多靶标药物发现的新思路。
1.3 网络药理学建模和分析
网络药理学是从系统生物学，特别是从生物网络的角度研究疾病的发生发展过程、认识药物与机体的相互作用并指导新药发现。网络药理学借助高通量组学数据、分子网络数据以及计算机模拟分析，进而从静态和动态角度研究药物的作用机制和促进药物创新。
1.4 多尺度系统整合
从系统水平，揭示药物和生物系统内基因、蛋白质，以及生化网路等各组成之间，在时间次序和空间位置上的相互关系和系统动力学功能。从而在不同层次信息上理解生物系统的复杂生命行为，最终实现在给定条件下对生物系统的干预、改造和修复。

提出背景
编辑 语音
系统药理学或系统药物学（Systems Pharmacology）概念和术语提出于1992年4月在广州召开了首届全国中西医学比较研讨会，大会上曾邦哲（曾杰）提出了系统医药学（systems medicine and pharmacology）的概念和模型 [1] ，采用图论和网络拓扑学方法，阐述了神经、内分泌、免疫与血管系统的机能活动与代谢器官的物质、能量代谢系统稳态模型，以及神经、内分泌与免疫细胞系统与基因、蛋白质、脂类等分子系统的双向调控生命活动与发育的过程。
2008年，2012年，NIH连续举办了第一、二届定量与系统药理学（Quantitative and Systems Pharmacology, QSP） 研讨会。两次会议将学界、产业界与政府机构（包括FDA）中从事药理学、系统生物学的专家们聚集起来讨论未来药物研发的新趋势。会议的核心议题：是否能够通过将系统生物学systems biology与药理学pharmacology进行交叉，融合出一个新的学科---定量与系统药理学（Quantitative and Systems Pharmacology, QSP），从而大大促进发现、开发和临床应用治疗药物的进程？在经过后续一年多的斟酌、讨论和咨询后，终于《定量与系统药理学白皮书》问世：Quantitative and Systems Pharmacology in the Post-genomic Era: New Approaches to Discovering Drugs and Understanding Therapeutic Mechanisms. 该成果标志着Systems Pharmacology新学科的诞生。

㈥ 网络药理学如何加实验

可以做一些蛋白上的实验。
例如elisa，免疫组化，wb等，检验一下核心靶标的表达。
蛋白质（protein）是组成人体一切细胞、组织的重要成分。机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。一般说，蛋白质约占人体全部质量的18%，最重要的还是其与生命现象有关。

㈦ 网络药理学中ko和hsa的区别

两者区别如下：
KO的意思：是knockout的简写。相信大家也知道，在拳击比赛中，假如一名拳手把另一名拳手打低，后者倒下，躺在擂台上，在一段指定时间内都无力起身继续比赛的话，则拳证会判后者被“击倒”，这就是knockout或KO了。
HSA是人血浆中的蛋白质。
所以，ko和hsa的区别:KO的意思：是knockout的简写。相信大家也知道，在拳击比赛中，假如一名拳手把另一名拳手打低，后者倒下，躺在擂台上，在一段指定时间内都无力起身继续比赛的话，则拳证会判后者被“击倒”，这就是knockout或KO了。

㈧ 网络药理学有用吗

有。
网络药理学是基于系统生物学的理论，对生物系统的网络分析，选取特定信号节点（Nodes）进行多靶点药物分子设计的新学科。网络药理学强调对信号通路的多途径调节，提高药物的治疗效果，降低毒副作用，从而提高新药临床试验的成功率，节省药物的研发费用。

㈨ 中药药理作用研究的具体方法

1 血清药理学方法学研究
在中药药理学研究中，有相当一部分药理活性实验和作用机理是在体外进行的，而利用中药粗提物直接进行体外实验，其结果的真实性和可靠性都受到很大影响。中药血清药理学研究方法是指给动物经口用药后一定的时间采血，取含药血清进行体外实验的一种研究方法，该方法由日本学者田代真一提出，95年前后国内即陆续开展。国家自然科学基金委员会曾于1996年资助重点项目：中药复方体外实验的方法学研究，在含药血清药理作用强度与体内给药的量效关系研究、给药方案研究、反应体系中含药物血清加入量的确定、采血时间的确定及时效关系研究、含药血清低温保存和血清灭活对效应的影响等方面做了大量卓有成效的工作。在以含头风饮(川芎、天麻为主)药物血清抗血小板释放5-HT和阻滞内皮细胞钙通 道作用为指标的实验中证实：在一定范围内，动物给药量与吸收入血的药物量及含药血清的体外药理效应呈正相关〔1〕；含药血清的药物浓度除与给药剂量有关外，还与给药方案 (如一日内给药次数及给药天数等)直接相关〔2〕；体外实验体系中含药血清加入量 的多少对药理效应产生明显的影响，因而对最佳反应体系的探索具有重要意义〔3〕 ；在采用血清药理学方法进行实验前，进行时效关系研究，找出给药后最佳采血时间是十分 必要的〔4〕；含药血清低温保存和血清灭活可能对药理效应产生明显影响，应以使 用新鲜血清或保存时间较短的血清
为宜〔 5〕。鉴于目前多数中药或复方有效成分尚不明确，成为制约中药现代研究的瓶颈，近年 进行了中药血清药化学与血清药理学协同研究的尝试，以揭示产生药效的物质基础。提出在 建立血清化学成分指纹图谱并测定相应含药血清药理效应强度后，进行药物效应成分分析， 如果含药血清的药理效应强度与其血清指纹图谱中某成分指纹峰大小相一致，则说明该成分 与所观察药理作用密切相关〔6〕。中药血清药理学针对中药及其复方复杂多样的化 学成分的特点，结合化学、微生物学、分子生物学等多学科的先进技术手段，将有可能成为 中药药理学研究的一种新的方法体系。
2 单味药药理研究
常用单味中药药理研究是中药药理研究的重要内容。近年仍以对整体动物 药理效应观察及对器官、组织、细胞的影响等为主，现代生物技术如分子生物学研究方法 也受到广泛关注和应用。研究的药味相对集中，以补益药、活血化瘀药居多，不少常用中药 的新药理作用机理被揭示。
研究发现黄芪对自然衰老大鼠脑皮质、海马、纹状体3个脑区降低的M胆碱受体和M1亚型受体密度有显着的上调作用，并可调节老年大鼠血浆环核苷酸含量〔7〕；衰老大鼠心肌 β受体密度及T3、T4、皮质醇含量均降低，黄芪、人参、枸杞子可 升高之〔8，9〕；对肝硬化大鼠存在的下丘脑血管加压素系统异常有改善作用 〔10〕；可以明显提高肾病综合征大鼠血浆白蛋白水平，改善肾小球滤过率和尿钠排泄 〔11〕；对环磷酰胺所致免疫功能抑制小鼠细胞毒活性有显着增强作用，并可能
通过调控巨噬细胞C1q的分泌功能来增强免疫和抗肿瘤作用〔12，13〕；还发现 黄芪煎剂及含黄芪小鼠血清均对小鼠脾淋巴细胞增殖、混合淋巴细胞培养反应及IL-2的产生有促进作用〔14〕。冬虫夏草水提液能降低正常心肌细胞内Ca2＋ 的浓度，减轻缺氧再给氧时细胞内Ca2＋超载现象，并明显减轻缺氧再给氧时细胞 内脂质过氧化〔15，16〕。红参在预防高血压性视网膜动 脉硬化起重要作用，能使内皮细胞膜的光整性、细胞器的结构及内皮细胞分泌各种血管舒缩 物质保持正常，抑制平滑肌细胞的异常增生，还有扩张血管、减少外周阻力及调节血压的作 用〔17〕。生地黄可明显抑制皮质酮致“阴虚”模型小鼠巨噬细胞Ia抗原 的高水平表达，降低其提呈抗原能力，从而表现出一定的免疫抑制作用〔18〕。丹参注射液可明显降低缺血再灌注引起的大鼠脑水肿，减少脑皮层及海马组织丙二醛含量，提高过氧化氢酶、超氧化物歧化酶活性和还原型谷胱甘肽、三磷酸腺苷的含量〔19〕。
3 有效部位、有效单体药理研究
随着中药化学成分提取、分离技术的进步，中药药理学与中药化学学科结合更为密切， 中药 有效部位、有效单体的药理研究日益增多。近年研究涉及的有效部位和有效单体有数十种， 研究较多、较深入的有人参皂甙、雷公藤多甙、三七皂甙、淫羊藿总黄酮、川芎嗪、天花粉 蛋白、牛膝多糖、地黄多糖等。有效部位、有效单体药理作用的深入研究，有助于揭示中药 治疗疾病的机理。研究发现，人参皂甙对辐射引起的细胞膜损伤有防护作用〔20〕 ；人参二醇皂甙对心肌缺血再灌注犬心脏功能具有保护作用〔21〕；人参根总皂甙 具有明显抗DNA损伤及抗突变效应〔22〕；人参皂甙Rb1对应激性性行为低下有保护 作用，其机制可能与抑制应激动物血浆皮质酮升高和提高睾酮水平有关〔23〕。雷 公藤多甙具有抗炎和免疫抑制作用，能显着降低人工晶体表面、虹膜和睫状体的炎症反应 〔24，25〕；对哮喘豚鼠肺组织的磷脂酶A2有明显抑制作用 〔26〕。三七总皂甙显着提高心肌细胞内肌浆网膜钙泵活性，减少心肌细胞Ca2 ＋〔27〕，对犬心肌缺血再灌注损伤有保护作用〔28〕。天花粉蛋白能 明显抑制小鼠黑色素瘤细胞S期DNA合成，通过抑制瘤细胞分裂增殖以及诱导瘤细胞凋亡而 抗肿瘤〔29〕。
4 复方药理研究
复方是中医用药的主要形式，以中医药理论为指导，运用现代科学手段，对古方和现代经验方进行多指标的系统药理研究，可以在更深的层次揭示方剂的治疗原理，有效地指导临床用药和中药新产品研创。近年来，中药复方在药效学、药代动力学和分子药理研究等方面取得了较好的进展。
近年古方的药理研究有数十首，其中桂枝汤、六味地黄汤、四君子汤、四物汤、大承气汤、 补中益气汤、当归补血汤等研究较多。在古方研究中较多地探讨了方剂的作用机制，给方剂 的传统功效描述赋予现代药理学内容。如桂枝汤可能通过影响兴奋胃肠运动的胃泌素、胃动素、P物质以及抑制胃肠运动的生长抑素、 血管活性肠肽等在下丘脑和胃肠道中的含量来调节胃肠运动〔30～33〕；桂枝汤 对与呼吸道感染有关的10株病毒致细胞病变均有不同程度的抑制作用，其含 药血清能抑制单纯疱疹病毒等4株病毒对Hep-2细胞的增殖〔34〕。当归补血汤 含药血清随给药剂量增加可使造血祖细胞集落数明显增多〔35〕。将六味地黄汤 方视为一个整体，以活性评价为导向，从六味地黄汤中定向追踪分离 ，获得了具有调节免疫功能的活性部位，该部位对TH及TC的功能有调节 作用〔36〕。这些研究都在一定程度上说明了方剂的作用原理。经验方的药理研究 开展得更为广泛，其研究内容多结合新药研究的有关要求，着重于药效及安全性评价，不少 方剂已经或即将开发为新药。
配伍是中医用药的特点和优势所在，用药理研究方法观察方剂配伍与药理效应变化之间的关系，探讨方剂的配伍规律，仍然是复方药理研究的重要内容。近年虽然还是以方剂药味加减 、正交设计等方法为主，但在应用中也有明显提高，采用一些新方法来更好地分析方剂的配伍问题〔37〕。关于复方配伍规律的基础研究99年纳入国家自然科学基金重点研究 项目，强调运用高新技术手段探讨方剂的物质基础，综合分析配伍-化学成分变化-药理效 应三者之间的联系，阐明配伍内涵，成为新的探索方向。生脉散复方化学动态变化与药效关 系研究表明，各药配伍后药效的变化可能与产生新物质有关〔38〕。以方剂的物质 基础研究为核心，注重方剂配伍理论与现代药理交互作用理论结合，物质基础分析与药理效 应观察相结合，从组成方剂的单味药、方剂的化学部分以及化学成分三个层次探讨方剂的配 伍与物质基础的变化的关系，在整体动物、器官组织、细胞亚细胞及分子生物学四个水平上 探讨方剂的配伍、物质基础的变化与药理效应间的联系，已成为复方配伍研究的基本思路 〔39〕。
5 药代动力学研究
药代动力学研究机体对药物的处理规律，对于深入了解药物的作用机理，指导临床合理用药 ，制定适宜的用药方案等均有重要意义。中药药代动力学尤其是方剂的药代动力学研究尚 无很好的方法和手段，目前主要采用体内药物浓度法、药物累积法(动物急性死亡率法)、药理效应法、微生物指标法等，但因受到诸多因素的制约，尚待进一步完善。近年进行了黄 芩 甙、葛根素、苦参碱、芸香甙、绿原酸、钩藤碱、马钱子碱、千金藤素等成分在动物体内的 药代动力学研究，但单一有效成分的药代参数显然还难以反映含有该成分的单味中药或复方 的药代动力学过程。1991年黄熙等提出复方效应成分动力学假说，将中药复方看作是一个整 体的药物，研究方剂效应成分在体内的命运。认为所谓“复方效应成分”可以是母方中的原 形单体，也可以是母方中不含有的新成分，既可能是一个，也可能是多个化学成分(组成)； “效应”既可以是活性效应，也可以是毒性效应〔40〕。有人提出综合运用中药有 效成分药动学-药效学同步分析统一模型、血清药理学方法及高效毛细管电泳、二维及三维 高效液相色谱法、液质联用或质质联用技术等，进行中药及复方的药代动力学研究〔4 1〕。

㈩ 网络药理学的利弊

网络药理学的利弊：

网络药理学的利：网络药理学是基于系统生物学的理论，对生物系统的网络分析，选取特定信号节点进行多靶点药物分子设计的新学科。网络药理学强调对信号通路的多途径调节，提高药物的治疗效果，降低毒副作用，从而提高新药临床试验的成功率，节省药物的研发费用。

网络药理学的弊：疾病靶点的选取过于主观在网络药理学研究的文章中,往往疾病靶点会到成百上千个,这个时候如果中药的成分比较少的话,就会出现药物靶点与疾病靶点的交集在各自总体的比例中失衡。

网络药理学的发展背景：

药物研发模式中，主要遵循“一个药物、一个基因、一种疾病”的模式，这是导致70%的新药在临床试验失败的主要原因。实际上，临床上的多种慢性病如肿瘤、心脑血管疾病、糖尿病等都是多基因、多因素作用的疾病，仅根据单一作用靶点难以达到良好治疗的效果。

以肿瘤的发生为例：形成一个立方厘米的实体瘤需要10年的时间，经过6大步骤：克服凋亡、抑制衰老（无限增殖）、分泌自我增殖信号、对生长信号不敏感、血管新生和侵袭，其中有大量的基因和蛋白参与作用。